分子海洋生物学分野

准教授

新里 宙也 Chuya SHINZATO, PhD

  • 東京大学大学院理学系研究科 生物科学専攻

研究理念

地球上で最も多種多様豊かな地域の一つ、サンゴ礁。多種多様な生命は、どのように進化し、そして支え合って生きているのでしょうか。この複雑な生命システムを統合的に理解するための研究を行っています。

Mail

c.shinzato[at]aori.u-tokyo.ac.jp
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TEL

04-7136-6212（内線66212）

Office

東京大学大気海洋研究所3階312号室

所属学会

日本動物学会／日本サンゴ礁学会／日本水産学会／共生生物学会

研究内容

  • 造礁サンゴと褐虫藻の全ゲノム解析

    造礁サンゴ（コユビミドリイシ）およびサンゴと共生する渦鞭毛藻、褐虫藻（Symbiodinium minutum）の全ゲノムを世界で初めて解読

  • 「サンゴホロビオント」丸ごと解析

    サンゴという生き物を構成するすべての生物を、全てまとめて同時に遺伝子解析

  • 海洋生物の保全遺伝学的研究

    遺伝子マーカーを用いたサンゴの集団解析と、それを応用したサンゴ礁の保全再生技術の開発

    • 全ての研究内容を見る

代表的な原著論文

Google Scholar "Chuya Shinzato"
  1. Shinzato C, Khalturin K, Inoue J, Zayasu Y, Kanda M, Kawamitsu M, Yoshioka Y, Yamashita H, Suzuki G, Satoh N.
    "Eighteen coral genomes reveal the evolutionary origin of Acropora strategies to accommodate environmental changes."
    Molecular Biology and Evolution (2020)
    Doi: 10.1093/molbev/msaa216
  2. Yoshioka Y, Yamashita H, Suzuki G, Zayasu Y, Tada I, Kanda M, Satoh N, Shoguchi E, Shinzato C.
    "Whole-genome transcriptome analyses of native symbionts reveal host coral genomic novelties for establishing coral-algae symbioses."
    Genome Biology and Evolution (2020)
    Doi: 10.1093/gbe/evaa240
  3. Shinzato C, Zayasu Y, Kanda M, Kawamitsu M, Satoh N, Yamashita H, Suzuki G.
    "Using seawater to document coral-zoothanthella diversity: A new approach to coral reef monitoring using environmental DNA."
    Frontiers in Marine Science (2018) 5: 28.
    Doi: 10.3389/fmars.2018.00028
  4. Yasuoka Y, Shinzato C, Satoh N.
    "The Mesoderm-Forming Gene brachyury Regulates Ectoderm-Endoderm Demarcation in the Coral Acropora digitifera."
    Current Biology (2016) 26: 2885-2892.
    Doi: 10.1016/j.cub.2016.08.011
  5. Shinzato C, Mungpakdee S, Arakaki N, Satoh N.
    "Genome-wide SNP analysis explains coral diversity and recovery in the Ryukyu Archipelago."
    Scientific Reports (2015) 5: 18211.
    Doi: 10.1038/srep18211
  6. Shoguchi E, Shinzato C, Kawashima T, Gyoja F, Mungpakdee S, Koyanagi R, Takeuchi T, Hisata K, Tanaka M, Fujiwara M, Hamada M, Seidi A, Fujie M, Usami T, Goto H, Yamasaki S, Arakaki N, Suzuki Y, Sugano S, Toyoda A, Kuroki Y, Fujiyama A, Medina M, Coffroth MA, Bhattacharya D, Satoh N.
    "Draft assembly of the Symbiodinium minutum nuclear genome reveals dinoflagellate gene structure."
    Current Biology (2013) 23: 1399-1408.
    Doi: 10.1016/j.cub.2013.05.062
  7. Shinzato C, Shoguchi E, Kawashima T, Hamada M, Hisata K, Tanaka M, Fujie M, Fujiwara M, Koyanagi R, Ikuta T, Fujiyama A, Miller DJ, Satoh N.
    "Using the Acropora digitifera genome to understand coral responses to environmental change."
    Nature (2011) 476: 320-323.
    Doi: 10.1038/nature10249