分子海洋生物学グループ
Molecular Marine Biology Group

准教授

新里 宙也 Chuya SHINZATO, PhD

  • 大学院理学系研究科 生物科学専攻
  • 新領域創成科学研究科 先端生命科学専攻

研究理念

地球上で最も多種多様豊かな地域の一つ、サンゴ礁。多種多様な生命は、どのように進化し、そして支え合って生きているのでしょうか。この複雑な生命システムを統合的に理解するための研究を行っています。

Mail

c.shinzato[at]aori.u-tokyo.ac.jp
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TEL

080-7122-3536（内線66212）

Office

東京大学大気海洋研究所3階312号室

所属学会

日本サンゴ礁学会／日本水産学会／共生生物学会

研究内容

  • 造礁サンゴと褐虫藻の全ゲノム解析

    造礁サンゴ（コユビミドリイシ）およびサンゴと共生する渦鞭毛藻、褐虫藻（Symbiodinium minutum）の全ゲノムを世界で初めて解読

  • 「サンゴホロビオント」丸ごと解析

    サンゴという生き物を構成するすべての生物を、全てまとめて同時に遺伝子解析

  • 海洋生物の保全遺伝学的研究

    遺伝子マーカーを用いたサンゴの集団解析と、それを応用したサンゴ礁の保全再生技術の開発

    • 全ての研究内容を見る

最近の代表的な原著論文

Google Scholar "Chuya Shinzato"
  1. Shinzato C, Yoshioka Y.
    "Genomic data reveal diverse biological characteristics of scleractinian corals and promote effective coral reef conservation."
    Genome Biology and Evolution (2024)
    Doi: 10.1093/gbe/evae014
  2. Yoshioka Y, Chiu YL, Uchida T, Yamashita H, Suzuki G, Shinzato C.
    "Genes possibly related to symbiosis in early life stages of Acropora tenuis inoculated with Symbiodinium microadriaticum."
    Communications Biology (2023)
    Doi: 10.1038/s42003-023-05350-8
  3. Uchida T, Yoshioka Y, Yoshida Y, Fujie M, Yamaki A, Sasaki A, Inoue K, Shinzato C.
    "Genomic and transcriptomic analyses illuminate the molecular basis of the unique lifestyle of a tubeworm, Lamellibrachia satsuma."
    DNA Research (2023)
    Doi: 10.1093/dnares/dsad014
  4. Tsuchiya K, Zayasu Y, Nakajima Y, Arakaki N, Suzuki G, Satoh N, Shinzato C.
    "Genomic analysis of a reef-building coral, Acropora digitifera, reveals complex population structure and a migration network in the Nansei Islands, Japan."
    Molecular Ecology (2022)
    Doi: 10.1111/mec.16665
  5. Shinzato C, Narisoko H, Nishitsuji K, Nagata T, Satoh N, Inoue J.
    "Novel mitochondrial DNA markers for scleractinian corals and generic-level environmental DNA metabarcoding."
    Frontiers in Marine Science (2021)
    Doi: 10.3389/fmars.2021.758207
  6. Shinzato C, Takeuchi T, Yoshioka Y, Tada I, Kanda M, Broussard C, Iguchi A, Kusakabe M, Marin F, Satoh N, Inoue M.
    "Whole-Genome Sequencing Highlights Conservative Genomic Strategies of a Stress-Tolerant, Long-Lived Scleractinian Coral, Porites australiensis Vaughan, 1918."
    Genome Biology and Evolution (2021)
    Doi: 10.1093/gbe/evab270
  7. Shinzato C, Khalturin K, Inoue J, Zayasu Y, Kanda M, Kawamitsu M, Yoshioka Y, Yamashita H, Suzuki G, Satoh N.
    "Eighteen coral genomes reveal the evolutionary origin of Acropora strategies to accommodate environmental changes."
    Molecular Biology and Evolution (2020)
    Doi: 10.1093/molbev/msaa216
  8. Yoshioka Y, Yamashita H, Suzuki G, Zayasu Y, Tada I, Kanda M, Satoh N, Shoguchi E, Shinzato C.
    "Whole-genome transcriptome analyses of native symbionts reveal host coral genomic novelties for establishing coral-algae symbioses."
    Genome Biology and Evolution (2020)
    Doi: 10.1093/gbe/evaa240