新里宙也

新里 宙也

Chuya SHINZATO, PhD

  • 東京大学大気海洋研究所 分子海洋生物学分野/准教授

E-mail

c.shinzato[at]aori.u-tokyo.ac.jp
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電 話

04-7136-6212(内線66212)

所 在

大気海洋研究所3階312号室

所属学会

日本動物学会/日本サンゴ礁学会/日本水産学会/共生生物学会

研究理念

地球上で最も多種多様豊かな地域の一つ、サンゴ礁。

多種多様な生命は、どのように進化し、そして支え合って生きているのでしょうか。

この複雑な生命システムを統合的に理解するための研究を行っています。

研究内容

造礁サンゴと褐虫藻の全ゲノム解析

造礁サンゴ(コユビミドリイシ)およびサンゴと共生する渦鞭毛藻、褐虫藻(Symbiodinium minutum)の全ゲノムを世界で初めて解読

サンゴホロビオント丸ごと解析

サンゴという生き物を構成するすべての生物を、全てまとめて同時に遺伝子解析

サンゴ礁の保全遺伝学的研究

遺伝子マーカーを用いたサンゴの集団解析と、それを応用したサンゴ礁の保全再生技術の開発

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研究業績

Google Scholar "Chuya Shinzato"

原著論文

  • 39 Maeda K, Saeki T, Shinzato C, Koyanagi R, Satoh N. (2017)
    "Review of Schismatogobius (Gobiidae) from Japan, with the description of a new species."
    Ichthyological Research
  • 38 Hall MR, Kocot KM, Baughman KW, Fernandez-Valverde SL, Gauthier MEA, Hatleberg WL, Krishnan A, McDougall C, Motti CA, Shoguchi E, Wang T, Xiang X, Zhao M, Bose U, Shinzato C, Hisata K, Fujie M, Kanda M, Cummins SF, Satoh N, Degnan SM, Degnan BM. (2017)
    "The crown-of-thorns starfish genome as a guide for biocontrol of this coral reef pest."
    Nature 544: 231–234.
  • 37 Nakajima Y, Wepfer PH, Suzuki S, Zayasu Y, Shinzato C, Satoh N, Mitarai S. (2017)
    "Microsatellite markers for multiple Pocillopora genetic lineages offer new insights about coral populations."
    Scientific Reports 7: 6729.
  • 36 Nakajima Y, Shinzato C, Khalturina M, Nakamura M, Watanabe H, Nakagawa S, Satoh N, Mitarai S. (2017)
    "Comparison of taurine related compounds in deep- and shallow-water mussel species."
    Marine Biodiversity
  • 35 Ohno Y, Iguchi A, Shinzato C, Inoue M, Suzuki A, Sakai K, Nakamura T. (2017)
    "An aposymbiotic primary coral polyp counteracts acidification by active pH regulation."
    Scientific Reports 7: 40324.
  • 34 Ohno Y, Iguchi A, Shinzato C, Gushi M, Inoue M, Suzuki A, Sakai K, Nakamura T. (2017)
    "Calcification process dynamics in coral primary polyps as observed using a calcein incubation method."
    Biochemistry and Biophysics Reports 9: 289–294.
  • 33 Campbell MA, Nielsen JG, Sado T, Shinzato C, Kanda M, Satoh TP, Miya M. (2017)
    "Evolutionary affinities of the unfathomable Parabrotulidae: Molecular data indicate placement of Parabrotula within the family Bythitidae, Ophidiiformes."
    Molecular Phylogenetics and Evolution
  • 32 Yasuoka Y, Shinzato C, Satoh N. (2016)
    "Regulates Ectoderm-Endoderm Demarcation in the Coral Acropora digitifera."
    Current Biology 26: 2885–2892.
  • 31 Nishitsuji K, Arimoto A, Iwai K, Sudo Y, Hisata K, Fujie M, Arakaki N, Kushiro T, Konishi T, Shinzato C, Satoh N, Shoguchi E. (2016)
    "A draft genome of the brown alga, Cladosiphon okamuranus, S-strain: a platform for future studies of 'mozuku' biology."
    DNA Research 23: 561–570.
  • 30 Zayasu Y, Nakajima Y, Sakai K, Suzuki G, Satoh N, Shinzato C. (2016)
    "Unexpectedly complex gradation of coral population structure in the Nansei Islands, Japan."
    Ecology and Evolution 6: 5491-5505.
  • 29 Zayasu Y, Shinzato C. (2016)
    "Hope for coral reef rehabilitation: massive synchronous spawning by outplanted corals in Okinawa, Japan."
    Coral Reefs 35: 1295–1295.
  • 28 Takeuchi T, Yamada L, Shinzato C, Sawada H, Satoh N. (2016)
    "Stepwise evolution of coral biomineralization revealed with genome-wide proteomics and transcriptomics."
    PLoS ONE 11: e0156424.
  • 27 Bhattacharya D, Agrawal S, Aranda M, Baumgarten S, Belcaid M, Drake JL, Erwin D, Foret S, Gates RD, Gruber DF, Kamel B, Lesser MP, Levy O, Liew YJ, MacManes M, Mass T, Medina M, Mehr S, Meyer E, Price Dc, Putnam HM, Qiu H, Shinzato C, Shoguchi E, Stokes AJ, Tambutte S, Tchernov D, Voolstra CR, Wagner N, Walker CW, Weber APM, Weis V, Zelzion E, Zoccola D, Falkowski PG. (2016)
    "Comparative genomics explains the evolutionary success of reef-forming corals."
    eLIFE 5: e132885.
  • 26 Mohamed AR, Cumbo V, Harii S, Shinzato C, Chan CX, Ragan MA, Bourne DG, Willis BL, Ball EE, Satoh N, Miller DJ. (2016)
    "The transcriptomic response of the coral Acropora digitifera to a competent Symbiodinium strain: the symbiosome as an arrested early phagosome."
    Molecular Ecology 25: 3127–3141.
  • 25 Nakajima Y, Shinzato C, Khalturina M, Nakamura M, Watanabe H, Satoh N, Mitarai S. (2016)
    "The mitochondrial genome sequence of a deep-sea, hydrothermal vent limpet, Lepetodrilus nux, presents a novel vetigastropod gene arrangement."
    Marine Genomics 16: 30030–30037.
  • 24 Nakajima Y, Zayasu Y, Shinzato C, Satoh N, Mitarai S. (2016)
    "Genetic differentiation and connectivity of morphological types of the broadcast-spawning coral Galaxea fascicularis in the Nansei Islands, Japan."
    Ecology and Evolution 6: 1457–1469.
  • 23 Shinzato C, Mungpakdee S, Arakaki N, Satoh N. (2015)
    "Genome-wide SNP analysis explains coral diversity and recovery in the Ryukyu Archipelago."
    Scientific Reports 5: 18211.
  • 22 Shoguchi E, Shinzato C, Hisata K, Satoh N, Mungpakdee S. (2015)
    "The large mitochondrial genome of Symbiodinium minutum reveals conserved non-coding sequences between dinoflagellates and apicomplexans."
    Genome Biology and Evolution 7: 2237–2244.
  • 21 Nakajima Y, Shinzato C, Satoh N, Mitarai S. (2015)
    "Novel Polymorphic Microsatellite Markers Reveal Genetic Differentiation between Two Sympatric Types of Galaxea fascicularis."
    PLoS One 10: e0130176.

レビュー

  • 05 Shinzato C, Mungpakdee S, Satoh N, Shoguchi E. (2014)
    "A genomic approach to coral-dinoflagellate symbiosis: studies of Acropora digitifera and Symbiodinium minutum"
    Frontiers in Microbiology 5: 336.
  • 04 Bosch T, Adamska M, Augustin R, Domazet-Loso T, Foret S, Fraune S, Funayama N, Grasis J, Hamada M, Hatta M, Hobmayer B, Kawai K, Klimovich A, Manuel M, Shinzato C, Technau U, Yum S, Miller DJ. (2014)
    "How do environmental factors influence life cycles and development?"
    BioEssays 36: 1185–1194.
  • 03 新里宙也 (2012)
    サンゴの遺伝子研究のこれまでの歩みとゲノム解読による新展開」
    海の研究』 21: 119–130.
  • 02 Ball EE, de Jong DM, Schierwater B, Shinzato C, Hayward DC, Miller DJ. (2011)
    "Cnidarian gene expression patterns and the origins of bilaterality - are cnidarians reading the same game plan as "higher" animals?."
    In: Key Transitions in Animal Evolution. Science Publishers, Enfield, NH, USA, pp. 197–216.
  • 01 Ball EE, de Jong DM, Schierwater B, Shinzato C, Hayward DC, Miller DJ. (2007)
    "Implications of cnidarian gene expression patterns for the origins of bilaterality - is the glass half full or half empty?"
    Integrative and Comparative Biology 47: 701–711.

その他

  • 08 新里宙也 (2017)
    サンゴ礁の保全・再生へ, ゲノム科学からの新しい取り組み」
    学術の動向』22巻3号, pp.92–95.
  • 07 佐藤矩行, 將口栄一, 新里宙也, 竹内猛, 川島武士 (2015)
    海洋生物のゲノム解読とその広がり」
    次世代シーケンサー活用術』第7章 化学同人.
  • 06 將口栄一, 新里宙也 (2014)
    サンゴ礁を生んだ無脊椎動物と藻類の共生は、どのように進化したのか?」
    細胞工学』 2014年4月号 Vol.33 No.4, pp.454–458.
  • 05 新里宙也 (2012)
    造礁サンゴ(ミドリイシ
    生物工学会誌』 第90巻 第6号, pp.353–355.
  • 04 新里宙也 (2011)
    サンゴ礁のゲノム科学」
    生物の科学 遺伝』 2011年11月号 Vol.65 No.6.
  • 03 新里宙也, 佐藤矩行 (2011)
    コユビミドリイシの全ゲノム解読とサンゴの環 境変動への応答の理解」
    ライフサイエンス新着論文レビュー <http://first.lifesciencedb.jp/archives/3354>.
  • 02 川島武士, 新里宙也 (2009)
    クラゲのゲノムが語る進化の"取捨選択"」
    科学』 2009年4月号, 岩波書店.
  • 01 川島武士, 濱田麻友子, 新里宙也, 佐藤矩行, 將口栄一 (2008)
    動物ゲノム解読の10年がもたらした新しい進化観」
    科学』2008年10月号, 岩波書店.