研究テーマ
種特異的な生息場所を決める分子機能の解明
生物の生きざまを支える遺伝子機能とその進化（井上）
硫化水素や金属に対する適応機構、環境浸透圧への適応機構、アミノ酸代謝ネットワークと環境適応
付着性生物の環境適応と付着機構（井上）
付着性生物のユニークな機能の解明 （浸透圧適応、水中接着と移動）
サンゴ礁の「マルチオミックス」解析
造礁サンゴの全ゲノム解読（新里）
世界初のサンゴゲノム解読、遺伝子解析によるサンゴの「謎」の解明
サンゴホロビオント丸ごと解析（新里）
サンゴ、および共生する褐虫藻をまとめて丸ごと解析、共生メカニズムやその維持機構の解明
自然環境の保全・遺伝的多様性の理解にむけて
メダカ類・イガイ類を用いる環境評価（井上）
東南アジアのメダカ近縁種、とくに海水適応可能な種の利用による環境評価、イガイ類への有害物質やマイクロプラスチックの影響評価
海洋生物の保全遺伝学的研究（新里）
サンゴの集団構造の解析や、DNA鑑定による効率的なサンゴ礁保全・再生の実現、環境 DNA を用いた海洋生物モニタリング手法の開発